Paper1 [Review] Epigenetics, fragmentomics, and topology of cell-free DNA in liquid biopsies 이 분야 빅가이 DENNIS Lo 랩의 리뷰 페이퍼. 2021리뷰지만 다시 정리해본다. 혈액속 cfDNA에는 많은 signal이 포함된다. - Epigenetics 1) methylation 세포의 유전자 발현 상태에 영향을 미칠 수 있는 CpG 부위가 약 2,800만 개 -Topology 1) 원형 및 단일 가닥 분자 - Fragmentomics 1) size : 짧은 단편의 증가 2) end motif(motif diversity score) : 선호하는 motif감소 (대표적 > CCCA) 4bp/6bp end, 6bp break point등 3) jagged end : ctDNA는 jagged end가 많음 PCR과정에서 복구되기에 복구된 부분의 메틸레이션을 확인해서 체크함. 4) preferre.. 2024. 1. 3. 이전 1 다음
